生態(tài)農業(yè)規(guī)劃是以生態(tài)學、經濟學和系統(tǒng)工程理論為指導，以經濟建設為中心，以社會調控為保障，以政策為引導，科技驅動，應用生態(tài)系統(tǒng)的原理和系統(tǒng)科學的方法，通過合理利用自然資源和人工模擬本地區(qū)的頂級生態(tài)系統(tǒng)，選擇多種在生態(tài)上和經濟上都有優(yōu)勢的生物，采用一套套生態(tài)農藝流程，按食物鏈關系和其他生態(tài)關系將這些物種的裁培、飼養(yǎng)和養(yǎng)殖組成一條條生產線，并將這些生產線在時間上和空間上多層次地配置到農業(yè)生態(tài)系統(tǒng)中去，使之既獲得持續(xù)大（或優(yōu)）的生產力和經濟效益，又獲得一個良好的、協(xié)調的生態(tài)系統(tǒng)。
　　規(guī)劃必須把長遠利益與近期設想統(tǒng)一起來，把種植業(yè)、養(yǎng)殖業(yè)、工商業(yè)和農田、村鎮(zhèn)、能源等多項建設密切結合起來，把發(fā)展農村經濟同保護生態(tài)環(huán)境結合起來，因此，進行生態(tài)農業(yè)規(guī)劃應遵循以下基本原則：
　　1、整體性原則。農業(yè)生態(tài)系統(tǒng)是受人工控制的自然、經濟、社會的復合系統(tǒng)，制定規(guī)劃時要以生態(tài)學原理和經濟規(guī)律為指導，用系統(tǒng)、整體觀念，進行全面規(guī)劃，做好總體布局。合理安排，統(tǒng)籌兼顧，協(xié)調農業(yè)內外各部門之間的關系，發(fā)揮系統(tǒng)的整體功能，實現生態(tài)、經濟、社會三大效益的同步增長。
　　2、資源開發(fā)、利用和保護相結合原則。對資源不僅要合理利用，還要積極的保護，對可更新資源合理利用與增殖，對不可更新資源合理利用與保護，只有這樣，方不致于對資源的開發(fā)利用消耗超過資源再生速度，使資源得到永續(xù)利用。
　　3、因地制宜的原則。農業(yè)生態(tài)系統(tǒng)的生態(tài)環(huán)境具有多樣性和地域差異性，各地區(qū)的農業(yè)生態(tài)工程設計和配套技術，生態(tài)農業(yè)的建設不可能是相同的，必須根據當地具體生態(tài)環(huán)境特點、自然條件和社會經濟條件，選擇農民群眾關心、見效快的項目。揚長避短，發(fā)揮地區(qū)優(yōu)勢，制定規(guī)劃，發(fā)展適合當地特點的類型和模式。
　　4、物質循環(huán)、多級利用的原則。根據生態(tài)學原理合理設計食物鏈，利用農業(yè)有機物質，包括“廢棄物”（指死體、殘體、排泄物）等實行多次利用、多級得益、循環(huán)利用和深加工等。
　　5、擴大綠色植被原則。綠色植物是轉化太陽能，實現性生產的重要機器，是保護生態(tài)環(huán)境重要的措施，應充分考慮將一切土地和部分水面綠化起來。
　　6、多業(yè)結合、集約經營原則。生態(tài)農業(yè)必須是多業(yè)結合，包括農業(yè)內部的橫向聯(lián)系和農業(yè)外部的橫向聯(lián)系，實行集約經營，揚長避短，發(fā)揮優(yōu)勢。
　　7、實現“三大效益”原則。生態(tài)農業(yè)建設措施必須達到生態(tài)上適宜，技術上可行，經濟上合理，有明顯的生態(tài)、經濟和社會效益。